Вариант 1

Если оставлять текущую организацию контента, то получится вот так. 

Есть 2 варианта  что делать по клику "Показать все":

1) Открывать попап все всех (показала на первых 3-х, это реальные данные)

2) Открывать попап только для Москвы, Питера, Казахстана и Германии, а для округов - вести на одну отдельную страницу, где будет перечень округов и областей : а) с попапами как в варианте 3 б) с разворачивающимся списком (см.Центральный ФО). Чтобы при переходе пользователь видел только свой округ, делаем ссылки с якорем на округ (см.ЦФО).


Обратите внимание, что в первые 3 организации вынесла не просто первые по алфавиту, а жирных, чтобы зацепить известными названиями. Плюс в округах разбила города по областям -  кажется, это важно с точки зрения ЦА: посмотреть кто из соседей уже ваши клиенты.

Москва

  • Известная компания 1
  • Известная компания 2
  • Известная компания 3

Санкт-Петербург

  • Известная компания 1
  • Известная компания 2
  • Известная компания 3

    Сибирский ФО

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Центральный ФО

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Северо-Западный ФО

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Южный ФО

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Северо-Кавказский ФО

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Приволжский ФО

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Уральский ФО

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Дальневосточный ФО

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Республика Крым

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Германия

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Казахстан

    • Известная компания 1
    • Известная компания 2
    • Известная компания 3

    Вариант 2

    То же, но без списка из 3 известных компаний.

    Москва

    Санкт-Петербург

    Сибирский ФО

    Центральный ФО

    Северо-Западный ФО

    Южный ФО

    Северо-Кавказский ФО

    Приволжский ФО

    Уральский ФО

    Дальневосточный ФО

    Республика Крым

    Германия

    Казахстан

    Вариант 3

    То же что в предыдущем варианте, но без рамки вокруг и здесь же сразу разбивка по округам. Для примера привела СФО. Получится много областей, ведь по каждому округу отдельные блоки. Сделать компактнее нельзя - ограничения конструктора.

    Москва

    Санкт-Петербург

    Новосибирск

    Екатеринбург

    Сибирский Федеральный Округ

    Республика Алтай

    Алтайский край

    Иркутская область

    Кемеровская область

    Красноярский край

    Новосибирская область

    Омская область

    Томская область

    Республика Тыва

    Республика Хакассия

    Вариант 4

    Главные категории - округа и страны, без Москвы и Питера. При разворачивании - области, по клику - ссылка на отдельную страницу. Якорь можно поставить только на округ, так что перейдя по ссылке, пользователю нужно будет снова найти свою область и кликнуть.